一、前身和称号的差异：
1、中统的前身是国民党中央组织委员会党务调查科，后来被改称为国民党中央执行委员会调查统计局，因其与党务相关，因此称为中统。
2、而军统的前身包括军事委员会密查科、军事委员会调查统计局第二处、复兴社特务处等部门，这些部门合并后成为了军统。由于这些部门都涉及军事，因此称为军统。
二、负责人的不同：
1、中统的负责人是陈果夫和陈立夫两兄弟，由国民党中央掌控。
2、军统的直接负责人是军统副局长戴笠，直接向蒋介石汇报。
三、职责范围的区别：
1、军统的主要职责是管理军队，收集军事情报，监视军事活动，并进行特务活动如暗杀和逮捕。军统属于国民党军队序列，其工作紧密关联军事领域。
2、中统则主要负责监视国民党内部党务，对外则采取各种手段打击其他党派和控制舆论。中统更多地涉及政治和内部党务。
四、调动警察权力的不同：
1、中统由于负责党务，具备调动警察等地方行政权力，以执行其任务。
2、军统则不具备直接调动警察的权力，只能向警察提出协助请求。然而，警察属于政务系统，对军统与中统之间的请求可能会有所选择和差异。
五、权力变化：
在国民党时期，由于“枪指挥党”的政策，军统与中统的权力关系存在变化。早期中统权力较大，后期军统的权力上升。但总体而言，这两个特务机构在不同阶段均为国民党政权服务。
军统和中统作为国民党的特务机构，尽管都有类似的任务，但由于这些方面的差异，使得它们在实际运作中有着明显的区别。这两个特务机构在国民党统治时期发挥了重要作用，但随着历史的变迁，它们的角色逐渐减弱，最终在历史的长河中逐渐淡出。
