巨齿鲨灭绝了，灭绝的原因根据推测，可能是因为在大约150万年前，地球上的水循环发生了变化，上升流减少，因为食物的缺乏，大量的鲸死亡，鲸的品种变少，巨齿鲨找不到足够的食物就逐渐灭绝了。但也有少数的科学家认为巨齿鲨没有灭绝，现在还存活着。有一些报道说发现了巨齿鲨，但经过检验，发现都是把姥鲨、鲸鲨等体型大的鲨鱼，错误地看成了巨齿鲨。
还有一种可能是经过漫长的岁月后，和其他生物一样，巨齿鲨逐步退化成了别的鲨鱼。有些古生物并非灭绝了，而是逐渐进化成新的物种，如原鸡进化成鸡一样。巨齿鲨可能是地球历史上已经发现的咬合力最强的生物，它口腔的撕咬力超过了霸王龙，很多古生物学家把它誉为地球史上最强悍的生物。
巨齿鲨可以捕食海中的任何生物，但最喜欢捕食鲸类，其他海洋哺乳动物也是它的盘中餐。成年巨齿鲨在开阔的大洋中猎食，幼年的则生活在离岸较近的海域中。巨齿鲨在当时无天敌，只有与巨齿鲨同为顶级掠食者的梅尔维尔鲸相匹敌。
