1、外观不同。藤椒主要为绿色的小颗粒，而花椒主要为红棕色的。
2、味道不同。藤椒和花椒都是调味品，然而藤椒的刺激比花椒要小。藤椒可以多用，而花椒要少用。
3、树木外观不同。花椒树外观大一点，枝叶较为松散，树枝比较粗壮。而藤椒树树形比较低矮，树枝比较紧凑，枝叶细小。
4、叶片外观不同。花椒不仅叶片较厚，而且叶片数目多，多为羽状复叶。而藤椒叶片较薄，而且叶片比起花椒来也相对较少，多为羽状复叶，而且有叶柄上有羽状翅。
5、果实外观不同。花椒果实有气孔无瘤状的突起，藤椒果实的瘤状比较明显，果皮在光线下有明显的亮点。
