1、干刷：干刷需要用到的工具有钢丝刷和钩针，用钢丝刷逐个刷，钩针可用于剔除大块的果肉以及纹理缝隙里的残渣，过程比较麻烦，最主要的是记得戴手套进行，以免伤到手了。
对于一些清理不理想的部分，可以用软鬃毛刷进行敲打，一只手拿着金刚菩提，一手拿刷子敲打在清理的部位。
2、水洗：用高压水枪清洗也是玩家发明的便捷又省力的方法，对着金刚菩提直接喷水。
还有就是先将金刚菩提浸泡在冷水中2-3小时，软化果肉残渣，然后取出边冲水边用钩针对皮渣进行清理。
清洗完毕后，将金刚菩提擦干阴干后就可以进行盘玩了，在盘玩佩戴过程中尽量不要沾水了，沾了水立刻擦干；也不要保存在潮湿的环境中，金刚菩提遇到潮湿的天气会发生霉变长毛；同时也不要出入温差过大的场合，热胀冷缩容易产生裂痕。
