1、内分泌因素：扁平苔藓患者女性较多，此病情波动与妊娠、更年期以及内分泌失调有关。
2、精神神经因素：患者可能因环境、家庭、工作及个人生活等因素，使其受到影响，产生失调紊乱而致病。
3、系统性疾病因素：患有扁平苔藓患者多伴和自身本来的疾病有关，如：肝炎、糖尿病、高血压消化道功能紊乱等。
4、遗传因素：据专家研究扁平苔藓的原因和遗传有关系，不少学者研究发现家族中携带的HLA型基因的扁平苔藓患者所，明显高于非家族性扁平苔藓，这说明扁平苔藓发病可能与遗传因素有关。
5、局部刺激因素：不同金属修复体在口内形成电位差或刺激等，使口腔粘膜苔藓改变。有报道说：银汞充填体引起苔藓样病损，少数患者也可能对铜、锌、银等产生变态反应。这些可能为迟发性超敏反应(Ⅳ型变态反应)接触性变态可能为游离汞进入粘膜后成为抗原而引起局部反应。
