mtDNA的PCR扩增与测序方法

 时间:2026-02-14 04:51:37

1、首先,根据Mabuchi等'报道的鱼类通用引物扩增mtDNA部分序列,剩余基因序列通过引物步移得到。反应模板DNA约为100 ng, 25 μL反应体系包括: Ex Taq 酶0.25 μL (2 U), 10xExTaq Buffer 2.5 μL,dNTPs 1 μL(各2.5 mmol/L),引物各0.5 μL (20 umol/L)。

mtDNA的PCR扩增与测序方法

2、然后,PCR反应程序: 94'C预变性3 min; 94°C变性30 s, 60C退火30 s(退火温度依特定引物),72°C延伸1 min, 35个循环;最后72C延伸10 min, 4'C保存。

mtDNA的PCR扩增与测序方法

3、然后,扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测,PCR产物由上海生工生物技术服务有限公司纯化,用ABI3770XL自动测序仪进行Sanger法双向测序。

mtDNA的PCR扩增与测序方法

4、然后,全序列的拼接与注释,通过NCBI BLAST检索,确定所得序列与GenBank中所收录的沙塘鳢属鱼类mtDNA 相应区段有较高序列相似性后,利用测序峰图结果分析软件DNA Baser V和Contig Express。

mtDNA的PCR扩增与测序方法

5、然后,将所有片段拼接成一个完整的mtDNA, 辅以人工校正。用Editseq 7.10和Mega 5.0统计序列总长、碱基组成和AT含量等信息;用在线软件tRNAscan-SE 1.2112进行tRNA基因定位并对二级结构进行预测,并辅助人工校正,对于tRNA scan-SE 1.21未能预测的tRNA。

mtDNA的PCR扩增与测序方法

6、最后,采用RNA structure 4.615预测茎环结构.mtDNA全序列经MitoFish'4注释后,提交GenBank(KF874495),用DNAMANS)和Geneious v.5.4构建mtDNA结构简图。

mtDNA的PCR扩增与测序方法

  • 注射剂的制备—难溶性药物注射剂的制备
  • 如何查找M1、M2的最新数据
  • 《非诚勿扰》女嘉宾俞夏最后牵手了么
  • vscode下latex如何设置表格的上标题?
  • android学习札记第1章之基本数据类型
  • 热门搜索
    山西五台山旅游攻略 日本自由行旅游攻略 山西平遥古城旅游攻略 宁波市旅游 长春旅游团 长春旅游网 铜川旅游景点大全 广州旅游景点排行 美国旅游签证新政策 大连旅游团