1、花芽分化不良。10月底11月上旬，很多棚室担心植株旺长而落花落果，未及时合理放棚保温导致夜温较低，直接影响花芽分化，形成空心果问题。棚室夜温偏低对蔬菜生长是一大逆境，不能进行正常受精，受精不良容易出现落花、落果、单性结实和畸形果的现象。夜温偏低，植株自身生理生化紊乱，极易引起生理性问题的发生危害。
3、根系发育不良。不合理的棚室管理造成根系生长发育不良，导致根系吸收钙镁等中微量元素受阻，直接影响花芽分化和授粉不良，引起空心果的产生。当前大多农户使用激素肥以及不合理的栽培模式、土壤板结盐渍化等原因使苗子在定植后出现浮根多、根系不下扎、侧根不发达的现象。造成后期的能量吸收不充分而造成先天发育不良。
5、不合理盲目喷施控棵药剂的影响。有的人为了控制辣椒长势，不间断的冲施或喷施控棵药剂，控旺药的实质是通过传导被根系吸收来抑制植株拔节过长而控制植株旺长。但植株的根茎叶花果实其实是一个整体，施药后可以肉眼看到地上部出现拔节短、果实变短的现象。但拔下根系观察也会发现地下部的根系生长也受到了一定的阻碍。根系类似弹簧根而不伸长，抑制了根系的生长发育和伸长，导致根系不发达不健壮，吸收矿质元素不足，影响花芽分化质量和花粉管的伸长而授精不良。
7、氮元素缺乏。不合理的盲目施肥（偏施钾肥等）、元素之间的拮抗作用抑制植株对氮素的吸收；棚室使用大量的稻壳，稻壳等粪肥在发酵腐熟过程中需要大量的氮元素，与植株争夺过多的氮元素，引起氮元素的缺乏。
