1、益生菌害怕杀菌和消毒
益生菌不应与具有杀菌和消毒活性的制剂同时服用，也不应与抗生素联合使用。因为益生菌中的活菌很容易被抗生素杀死，所以它们根本不起作用。如果疾病需要同时服用抗生素和益生菌，建议两种药物的间隔时间超过2小时
2、益生菌害怕酒精
酒精是一种常用的杀菌消毒剂。酊中乙醇含量高，不宜与益生菌同时服用。酊是将原料药浸入酒精或将化学物质溶于酒精中的药物，如颠茄酊、橙皮酊、碘酊等。
3、益生菌怕热
益生菌作为一种活菌，在肠道中存活，其最适生长温度与人体肠道相似，约37°C。因此，益生菌最好保存在阴凉干燥的地方，有些药物甚至需要冷藏。同时，益生菌的水温不应超过40°C，否则益生菌将被烧死。
4、益生菌害怕抑制和吸附
如果病人有胃炎或腹泻，医生可能会开胶体铋果胶、单宁酸制剂、药物碳或蒙脱土粉等药物，但这些药物会抑制细菌的生长，或吸附细菌，然后直接从体内取出，从而影响益生菌的功效。因此，上述药物不能与益生菌同时服用，应分时段服用。
